Jeudi, 20 mars⋅– 13:00 -salle 401

Séminaire TBI / JL Parrou / N Marsaud

Le séquençage en Long Fragment et la PCR digitale : De nouveaux services de proximité sur GeT-Biopuces

Nathalie Marsaudet Jean-Luc Parrou vous présenteront les dernières évolutions de la plateformeGeT-Biopuces, avec l’implantation d’une technologie de séquençage en ‘longsfragments’, le MinION, et l’arrivée du QIACUITY, une technologie PCR detroisième génération. Le personnel est disponible pour vous accompagner dansvos projets et vous guider vers les outils les plus adaptés à vosquestionnements, mais venez donc (re)découvrir ces deux technologies et leurpotentiel lors de ce séminaire.

Avec le MinION, validez laséquence de vos plasmides ou souches d’intérêt

Nathalie vous présentera le MinION de chez ONT (Oxford Nanopore Technologies), un séquenceur de poche de la taille d’une clé USB mais capable de produire des fragments de très longue taille (Long Read sequencing). Facile à mettre en œuvre avec des préparations de librairies simplifiées, vous pourrez séquencer vos plasmides, fosmides et génomes d’intérêt en quelques heures à partir de quelques dizaines de nanogrammes d’ADN.  La longueur des fragments est suffisante pour échapper aux pièges des séquences répétées lors de l’assemblage final, et la profondeur est telle que vous obtiendrez des séquences complètes de très grande qualité.

La PCR digitale, un jeu d’enfant !

Avec le QIACUITY à partitionnement solide de chez QIAGEN, la PCR digitale devient en effet un jeu d’enfant ! Mise en œuvre simplifiée : mélanges réactionnels standards, transfert des mélanges dans les puits de la ‘nanoplate’ de votre choix, puis chargement de cette dernière dans l’appareil… et le tour est joué !Deux heures plus tard, accédez à une quantification absolue d’une précision et d’une sensibilité inégalées. Jean-Luc vous présentera le principe de cette technologie et quelques résultats déjà validés sur la plateforme GeT-Biopuces :  analyses de type CNV et du nombre de copies de plasmides, étude de l’expression génique à l’échelle de la cellule unique, détection de traces d’ADN, même dans des environnements normalement inhibiteurs pour la PCR, ou encore analyse de communautés avec la possibilité de multiplexer jusqu’à cinq sondes. Venez découvrir l’incroyable potentiel de cette technologie et voir comment lever les verrous de vos projets !

Lundi, 24 mars⋅– 14:00 – salle 401

Séminaire TBI / Gaetan BLANDIN

Improving circularity in water reuse, resource recovery and desalination: current research developed in Lequia 

Seawater desalination and water reuse are nowadays state of the art technologies for alternative water sources where reverse osmosis (RO) desalination process play a main role as a barrier to salts and most contaminants. While energy continues to be a limitation for broader desalination plants implementations, assuring safe water reuse and public acceptance is a remaining concern for water reuse development. Apart from recovering and producing water of the highest quality, moving towards circularity also includes reducing energy consumption, making use of nutrients recovery as well as considering membrane reuse. Those approaches are considered through 3 projects developed in Lequia: Forward Factory, ConcentrA and Osmo4Lives. Forward Factory aims at reducing energy costs in desalination down to 1kWh.m-3 while allowing for 90% water recovery from wastewater using Forward Osmosis (FO) as central technology. Additionally, sides benefits could be obtained through the concentration of nutrients from the wastewater (organic matter, N, P) to facilitate their downstream recovery and transformation into valuable resources. ConcentrA projects aims at separating and concentrating volatile fatty acids from fermentation of agrifood industry wastewater streams to facilitate downstream bioplastics (PHA) production. Finally, Osmo4Lives objectives are to recycle end of life reverse osmosis (RO) membranes to give then 4 additional lives and to validate recycled membranes in various applications.

Jeudi, 27 mars⋅– 13:00

Séminaire TBI / Alain Marty

Jeudi, 3 avril⋅-13:00 à 14:00

Lieu : salle 401

Innovating Towards a Sustainable Bioeconomy Future

An important current focus of research in biology, chemistry, engineering, agriculture, and environmental sciences is the development of clean technologies that utilize cellulosic biomass as a renewable resource to the largest extent possible in a biorefinery setting to produce sustainable liquid transportation fuels, chemicals and materials. Of all sustainable resources, only biomass can be
transformed into organic fuels, chemicals, and materials that can integrate well into our current infrastructure with the inherent convenience, cost, and efficiency advantages. Cellulosic biomass can be converted to biofuels and bioproducts through aqueous-phase processes involving carbohydrates-derived and lignin-derived reactive intermediates deconstructed from these structural components
within biomass. Conversion of all major biopolymers within biomass, including lignin in addition to cellulose and hemicellulose, offers promising opportunities for enhancing the overall operational efficiency, carbon conversion yield, economic viability, and sustainability of biorefinery. Despite the potential, the conversion of lignin to biofuels has proven to be challenging. In this talk, an overview of
state-of-the-art technologies for advanced biofuels production as well as Prof. Yang’s recent research and development on both catalytic and biological pathways to upgrade lignin to jet fuel, chemicals, and materials will be discussed.